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1.民國 47 年 9 月設立五甲國民學校深坑分班。 2.民國 48 年 9 月改設深坑分校。 3.民國 52 年 8 月獨立為深坑國民學校。 4.民國 57 年 8 月改稱深坑國民小學。 5.民國 87 年 12 月附設幼稚班。 6.民國 99 年 12 月臺南縣市合併升格為直轄市，校名全稱改為「臺南市關廟區深坑國民小學」。
